Asia Graduate School of Theology/Japan（以下AGST/J）は、Doctor of Ministry（D.Min.）、Master of Theology（Th.M.）、Doctor of Theology（Th.D.）の三つの課程を置いています。
D.Min.は、M.Div.を持った牧師が一定年数以上の経験を経た後に、教会の牧会現場において研鑽を続けるためのプログラムで、実践的課題への学際的取り組みがなされる課程です。
Th.M.は、M.Div.を持った者が、神学的にさらに深め、特定の領域における学問的研鑽と資質を身につけるためのプログラムです。神学教育機関の教師や研究者の育成を目指しています。
Th.D.は、Th.Mもしくは同等の資格を持った者が、専門分野において深く広く研究し、神学教育機関で働くことを使命とする神学教師を育成することを主な目的にしています。